Felipe Carrillo Puerto es el centro neurálgico de la Zona Maya. Se fundó en 1850 con el nombre de Chan Santa Cruz o "Pequeña Santa Cruz", capital santuario de los cruzoob durante la Guerra de Castas. Ahí ocurrió el episodio de la "Cruz Parlante".
Durante más de medio siglo resistió a las tropas del gobierno. Cuando finalmente cayó, en 1901, ya había edificios de piedra, una gran plaza, amplias y bien trazadas calles y una iglesia que, al parecer, es la única en América construida por indígenas. El templo aún se conserva en el centro de la ciudad y puede ser visitado, pero la enorme cruz de madera que constituye su única decoración no es la original. En 1932 Chan Santa Cruz fue rebautizada Felipe Carrillo Puerto en honor de un gobernador de Yucatán con ideas socialistas. Entre otros atractivos de Carrillo Puerto se hallan el Santuario de la Cruz y las ceremonias que en determinadas fechas celebran los sacerdotes mayas en honor de la Cruz Parlante.